当前位置:首页 > 数据库 > 正文内容

decipher数据库,疾病相关基因组结构变异的宝库

admin1个月前 (12-11)数据库27

DECIPHER是一个交互式的网络数据库,专门用于存储和共享人类基因组变异和表型数据。以下是DECIPHER数据库的一些关键用途和特点:

用途1. 数据共享和比较:DECIPHER被临床社区广泛用于共享和比较表型及基因型数据。该数据库包含来自49,745名患者的数据,这些患者同意广泛的数据共享。2. 致病性CNV的筛选:DECIPHER数据库专门收录与异常临床表型相关的拷贝数变异(CNV)结果,大多数属于致病性CNV。这些数据可以用于筛选和识别致病性CNV。3. 疾病相关的CNV信息:通过该数据库,可以查看已知的疾病相关的CNV信息,帮助科研人员在筛选致病性CNV时使用该数据库作为一个过滤条件。4. 研究工具:DECIPHER提供基因组结构变异分析工具,帮助科研人员查找和理解致病基因。用户可以通过基因、表型等多种方式查询相关信息。

特点1. 多模块支持:DECIPHER数据库包括多个模块,如Genome browser、Phenotype browser、Genes、CNV Syndromes和Gene Disorders等,帮助用户从多个角度分析数据。2. 高级搜索功能:DECIPHER具备高级搜索功能,允许用户使用多种术语组合进行查询,包括表型、基因符号、染色体位置/带和其他字段。3. 国际性合作项目:DECIPHER是一个国际性的合作项目,汇集了多个临床中心的数据,提供基因组结构变异分析工具,关联疾病表型。4. 数据存储和管理:DECIPHER数据库能够高效地存储和管理各种类型的数据,支持多种数据类型和格式,具备强大的查询和分析功能。

DECIPHER数据库在基因组变异和表型数据的共享、比较和分析方面提供了强大的支持,对于临床研究和疾病诊断具有重要意义。

DECIPHER数据库:疾病相关基因组结构变异的宝库

随着基因组学研究的不断深入,越来越多的疾病被揭示与基因组结构变异(CNV)有关。为了更好地整合和利用这些数据,DECIPHER数据库应运而生,成为全球科学家研究疾病相关CNV的重要工具。

什么是DECIPHER数据库?

DECIPHER(Database of Genomic Variants in Individuals with Rare Disorders)是一个国际化的合作项目,由200多个临床中心和1600多个遗传学家和实验室共同参与。该数据库旨在整合各种生物信息资源,提供一套全面的工具来识别与患者表型相关的基因组结构变异,挖掘潜在的致病基因。

DECIPHER数据库的特点

DECIPHER数据库具有以下特点:

数据来源广泛:DECIPHER数据库整合了来自全球多个研究机构的CNV数据,涵盖了多种疾病和表型。

数据更新及时:DECIPHER数据库会定期更新,确保用户获取最新的研究进展。

功能丰富:DECIPHER数据库提供了多种查看方式,包括基因组浏览器、表型浏览器、基因和CNV综合征等,方便用户从不同角度分析数据。

易于使用:DECIPHER数据库界面友好,用户可以轻松地搜索和浏览数据。

DECIPHER数据库的查看方式

DECIPHER数据库提供了多种查看方式,以下是几种常见的查看方式:

基因组浏览器:通过基因组浏览器,用户可以查看染色体特定位置、特定基因或cytoband区域的变异分布情况。在表示CNV时,蓝色代表gain,红色代表loss。

表型浏览器:用户可以查看各种表型对应的信息,点击“Find all”链接,可以查看该表型相关的CNV数据。

基因:以基因为单位,展示了与疾病表型相关的基因组变异所在的基因。

CNV综合征:展示了与发育障碍综合征相关的CNV变异,以list和染色体分布两种形式进行展示。

基因疾病:展示了clinvar数据库中与表型相关的基因变异信息。

DECIPHER数据库的应用

DECIPHER数据库在疾病研究、临床诊断和基因治疗等领域具有广泛的应用价值。

疾病研究:DECIPHER数据库可以帮助科学家识别与疾病相关的CNV,从而揭示疾病的致病机制。

临床诊断:DECIPHER数据库可以为临床医生提供疾病诊断的参考依据,提高诊断的准确性。

基因治疗:DECIPHER数据库可以帮助研究人员寻找合适的基因治疗靶点,为基因治疗提供理论依据。

DECIPHER数据库是一个重要的生物信息资源,为全球科学家研究疾病相关CNV提供了有力支持。随着基因组学研究的不断深入,DECIPHER数据库将继续发挥重要作用,为人类健康事业做出贡献。

DECIPHER数据库, 基因组结构变异, CNV, 疾病研究, 临床诊断, 基因治疗

扫描二维码推送至手机访问。

版权声明:本文由51Blog发布,如需转载请注明出处。

本文链接:https://www.51blog.vip/?id=1326

分享给朋友:

“decipher数据库,疾病相关基因组结构变异的宝库” 的相关文章

海港企业数据财物消费实践,系统化整理数据财物、深度开释数据要素潜力

海港企业数据财物消费实践,系统化整理数据财物、深度开释数据要素潜力

港口企业作为交通运输枢纽,需求凭借数字化手法进步办理水平、优化出产流程、进步运营功率,以习惯日益增长的事务量和竞赛压力。为了辅导各地才智港口的建造作业,交通运输部等多部分联合发布了《才智港口建造攻略》,清晰了才智港口建造的方针、准则、途径及要点使命,为港口的数据化、智能化供给了具体辅导。跟着物联网、...

用access创建数据库,如何使用Microsoft Access创建数据库

Access 是微软公司开发的一款关系型数据库管理系统,常用于小型企业和个人用户。它提供了用户友好的界面和强大的数据处理功能。下面是使用 Access 创建数据库的基本步骤:1. 启动 Access: 双击桌面上的 Access 图标,或从开始菜单中启动 Access。2. 选择新建数据库:...

mysql和redis的区别,深入解析两种数据库技术的区别

mysql和redis的区别,深入解析两种数据库技术的区别

MySQL和Redis是两种常用的数据库系统,但它们的设计理念和用途有很大的不同。以下是它们之间的一些主要区别:1. 数据类型: MySQL:关系型数据库,使用SQL语言进行数据操作,支持复杂的数据结构和关系,如表、视图、存储过程等。 Redis:键值存储系统,支持多种数据类型,如字符串...

大数据的核心是什么,数据整合与价值挖掘

大数据的核心是什么,数据整合与价值挖掘

大数据的核心在于数据本身以及对其进行的处理和分析。大数据通常指的是规模庞大、类型多样、处理速度要求高的数据集,这些数据集可能来源于互联网、社交媒体、物联网设备、企业内部系统等多种渠道。大数据的核心包括以下几个方面:1. 数据采集:从各种来源收集数据,包括结构化数据(如数据库中的数据)和非结构化数据(...

mysql导入文件,MySQL数据库导入文件详解

mysql导入文件,MySQL数据库导入文件详解

在MySQL中,你可以使用多种方法导入文件,包括SQL文件、CSV文件等。以下是几种常见的方法:1. 使用 `mysql` 命令行工具导入SQL文件: ```bash mysql u username p database_name 2. 使用 `LOAD DATA INFILE` 语句导入...

数据库基础,数据库概述

数据库基础,数据库概述

数据库基础是一个涉及多个主题的广泛领域,包括数据模型、数据库设计、数据查询语言、数据库管理和数据库安全等。下面是一些数据库基础的关键概念和组成部分:1. 数据模型: 关系模型:由E.F. Codd提出,是现代数据库系统中最常用的模型。它基于表(关系)和列(属性)的结构,通过键(如主键和外键)来...