decipher数据库,疾病相关基因组结构变异的宝库
DECIPHER是一个交互式的网络数据库,专门用于存储和共享人类基因组变异和表型数据。以下是DECIPHER数据库的一些关键用途和特点:
用途1. 数据共享和比较:DECIPHER被临床社区广泛用于共享和比较表型及基因型数据。该数据库包含来自49,745名患者的数据,这些患者同意广泛的数据共享。2. 致病性CNV的筛选:DECIPHER数据库专门收录与异常临床表型相关的拷贝数变异(CNV)结果,大多数属于致病性CNV。这些数据可以用于筛选和识别致病性CNV。3. 疾病相关的CNV信息:通过该数据库,可以查看已知的疾病相关的CNV信息,帮助科研人员在筛选致病性CNV时使用该数据库作为一个过滤条件。4. 研究工具:DECIPHER提供基因组结构变异分析工具,帮助科研人员查找和理解致病基因。用户可以通过基因、表型等多种方式查询相关信息。
特点1. 多模块支持:DECIPHER数据库包括多个模块,如Genome browser、Phenotype browser、Genes、CNV Syndromes和Gene Disorders等,帮助用户从多个角度分析数据。2. 高级搜索功能:DECIPHER具备高级搜索功能,允许用户使用多种术语组合进行查询,包括表型、基因符号、染色体位置/带和其他字段。3. 国际性合作项目:DECIPHER是一个国际性的合作项目,汇集了多个临床中心的数据,提供基因组结构变异分析工具,关联疾病表型。4. 数据存储和管理:DECIPHER数据库能够高效地存储和管理各种类型的数据,支持多种数据类型和格式,具备强大的查询和分析功能。
DECIPHER数据库在基因组变异和表型数据的共享、比较和分析方面提供了强大的支持,对于临床研究和疾病诊断具有重要意义。
DECIPHER数据库:疾病相关基因组结构变异的宝库
随着基因组学研究的不断深入,越来越多的疾病被揭示与基因组结构变异(CNV)有关。为了更好地整合和利用这些数据,DECIPHER数据库应运而生,成为全球科学家研究疾病相关CNV的重要工具。
什么是DECIPHER数据库?
DECIPHER(Database of Genomic Variants in Individuals with Rare Disorders)是一个国际化的合作项目,由200多个临床中心和1600多个遗传学家和实验室共同参与。该数据库旨在整合各种生物信息资源,提供一套全面的工具来识别与患者表型相关的基因组结构变异,挖掘潜在的致病基因。
DECIPHER数据库的特点
DECIPHER数据库具有以下特点:
数据来源广泛:DECIPHER数据库整合了来自全球多个研究机构的CNV数据,涵盖了多种疾病和表型。
数据更新及时:DECIPHER数据库会定期更新,确保用户获取最新的研究进展。
功能丰富:DECIPHER数据库提供了多种查看方式,包括基因组浏览器、表型浏览器、基因和CNV综合征等,方便用户从不同角度分析数据。
易于使用:DECIPHER数据库界面友好,用户可以轻松地搜索和浏览数据。
DECIPHER数据库的查看方式
DECIPHER数据库提供了多种查看方式,以下是几种常见的查看方式:
基因组浏览器:通过基因组浏览器,用户可以查看染色体特定位置、特定基因或cytoband区域的变异分布情况。在表示CNV时,蓝色代表gain,红色代表loss。
表型浏览器:用户可以查看各种表型对应的信息,点击“Find all”链接,可以查看该表型相关的CNV数据。
基因:以基因为单位,展示了与疾病表型相关的基因组变异所在的基因。
CNV综合征:展示了与发育障碍综合征相关的CNV变异,以list和染色体分布两种形式进行展示。
基因疾病:展示了clinvar数据库中与表型相关的基因变异信息。
DECIPHER数据库的应用
DECIPHER数据库在疾病研究、临床诊断和基因治疗等领域具有广泛的应用价值。
疾病研究:DECIPHER数据库可以帮助科学家识别与疾病相关的CNV,从而揭示疾病的致病机制。
临床诊断:DECIPHER数据库可以为临床医生提供疾病诊断的参考依据,提高诊断的准确性。
基因治疗:DECIPHER数据库可以帮助研究人员寻找合适的基因治疗靶点,为基因治疗提供理论依据。
DECIPHER数据库是一个重要的生物信息资源,为全球科学家研究疾病相关CNV提供了有力支持。随着基因组学研究的不断深入,DECIPHER数据库将继续发挥重要作用,为人类健康事业做出贡献。
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